Знакомая ситуация, у меня была такая же беда. Лучше всего для таких дел используется битумная мастика для кровли . Она отлично справляется с задачей — закрывает все щели и трещины, защищает от воды и стоит недорого. Я покупал её в строительном магазине "Первый Дом", там хороший выбор и мастики разных производителей, так что можно найти именно то, что тебе подойдёт. Я пару лет назад все швы промазал, с тех пор ни одной протечки. Рекомендую попробовать, результат тебя точно порадует!